Les nombreuses fonctions du microbiote
Protrection
contre les micro-organismes nuisibles, par exemple les virus
Influence
sur le poids et le métabolisme des calories
Digestion
de notre alimentation et influence sur l’assimilation des nutriments
Régulation
de l’humeur, du sommeil et du bien-être
Entraînement
du système immunitaire pour distinguer les bons des mauvais acteurs
Production
de substances importantes, telles que la sérotonine, les vitamines (B12, K et folate)
Procédure de l'analyse de microbiote
1. Le prélèvement de l'échantillon
Le récipient pour le recueil de l'échantillon contient une solution qui préserve l'ADN des bactéries intestinale pendant 2 ans et le stabilise à -20 à +40C. BIOMES utilise avec une méthode très spécifique et sensible, qui permet de détecter presque toutes les bactéries intestinales connues d'une personne dans un seul échantillon de selles. On retrouve même de l'ADN dans de petites quantités de selles: un minuscule échantillon suffit pour cartographier le génome entier des bactéries intestinales présentes.
2. Préparation de l'ADN microbien avec la méthode de laboratoire propre à BIOMES
Une flore intestinale saine contient un grand nombre de bactéries vitales. L'ADN des bactéries contient des informations sur le type, la structure et la fonction de chaque organisme. La séquence d'acides nucléiques dans le brin d'ADN code l'information génétique pour les éléments constitutifs d'une bactérie. Pour obtenir ces informations, il faut d'abord isoler l'ADN (extraction). BIOMES analyse uniquement l'ADN des microbes contenus dans l'échantillon, pas l'ADN.
3. Analyse de l'ADN microbien avec le séquençage de nouvelle générations (NGS)
Nous procédons ensuite à l'analyse d'un gène spécifique des micro-organismes, appelé ADNr 16s. Toutes les bactéries possèdent ce gène, la séquence de base est propre à chaque organisme.
Pour l'analyse, les régions pertinentes de l'ADN bactérie isolé sont amplifiés (séquençage). Pour préparons ensuite l'ADN de chaque échantillon pour le séquençage de nouvelle génération. Afin de pouvoir identifier l'échantillon ultérieurement, nous attachons un code-barres synthétique.
Le séquençage de nouvelle génération est une technique qui permet d'étudier la séquence des acides nucléiques et donc la base de l'identification des bactéries contenues dans l'échantillon.
4. Contrôle de la qualité des séquences d'ADN dans un pipeline des logiciels propriétaires
En d'autres termes, nous convertissons l'ADN biologique des bactéries intestinales en ADN numérique, grâce au séquençage de nouvelle génération. Les informations biologiques des bactéries, qui sont codées dans leur ADN, deviennent ainsi lisibles numériquement par l'ordinateur.
Nous utilisons un logiciel développé en interne pour vérifier la qualité des données. Une fois cette étape terminée, nous disposons de données contenant des informations sur toutes les bactéries trouvées dans l'échantillon concerné.
5. Comparaison de l'ADN tous les génomes microbiens connus
Avant de pouvoir créer un profil bactérien individuel, ces doivent être comparées à tous les génomes bactériens connus. Ce processus est appelé "carthographie". Les séquences d'ADN trouvées dans l'échantillon sont comparées à une base de données contenant tous les gènes bactériens connus.
Il en résulte un profil unique dans lequel toutes les bactéries contenues dans l'échanitllon ont été identifiées mais aussi quantifiées. En effet, il est important de savoir quelles bactéries une personne possède, mais aussi en quelle quantité et comment elles sont réparties.
6. Analyse du profil avec la base de connaissances BIOMES pour les propriétés physiologiques
Il n'est pas seulement important de savoir quelles bactéries vivent dans l'intestin d'une personne et en quel nombre. Il est également important de comprendre quelles fonctions ces bactéries remplissent. C'est la seule façon d'interpréter le profil individuel du microbiome.
Les scientifiques de BIOMES ont ainsi passé plusieurs années à constituter une base de méta-connaissances qui rassemble les résultats de plus de 7900 études sur le microbiome dans le monde. Les études sont sélectionnées selon des critères d'évaluation stricts. La recherche sur le microbiome est un domaine récent.
BIOMES ne fait que des déclarations sur des domaines de la flore intestinale qui ont déjà fait l'objet de recherches approfondies.
7. Comparaison du profil de microbiote avec l'ensemble de tous les profils de microbiote dans BIOMES-Community
Les valeurs de référence sont largement utilisées en médecin pour déterminer une valeur universellement aceptée pour indiquer ce qui est considéré comme sain ou malade. Toutefois, des valeurs différentes doivent être appliquées à des personnes se trouvant des des situations de vie différentes. En d'autres termes: ce qui est considéré comme sain pour une femme de 80 ans qui a suivi toute sa vie un régime omnivore, ne l'est pas nécessairement pour un jeune vegan de 18 ans.
Pour cette raison, BIOMES travaille également avec la BIOMES community pour l'interprétation des données. A cette fin, nous formons des sous groupes, correspondant à la personne concernée, afin de pouvoir déterminer plus précisément les déviations du profil du microbiome.
8. Profil personnalisé du microbiote avec des recommandations individuelles fondées sur des données probantes
Il en résulte un rapport détaillé mais compréhensible, dans lequel les bactéries sont regroupées selon leur fonction dans différents domaines. Cela nous permet de proposer des recommandations en matière d'alimentation et de mode de vie pour chaque point faible. Toutes les interprétations s'appuient sur les connaissances de BIOMES et sont donc fondées à 100% sur des preuves. La littérature scientifique primaire est liée de manière transaparente.
Histoire de la science
De l'observation microscopique à l'analyse de l'ADN. 🔬
Autrefois, les scientifiques utilisaient des microscopes pour compter et identifier les bactéries, en se concentrant sur des germes spécifiques comme la salmonelle.
Cependant, cette méthode n’était pas suffisamment efficace, car elle ne permettait pas de détecter toutes les bactéries présentes.
Aujourd’hui, nous utilisons une méthode bien plus avancée : l’analyse de l’ADN bactérien.
Comprendre l'importance de notre ADN. 🧬
L'ADN est l'élément de base de toute vie, y compris des humains et des bactéries qui vivent en nous.
Chaque morceau d’ADN contient une énorme quantité d’informations. Plutôt que d'essayer de voir ces détails au microscope, nous extrayons l’ADN des bactéries présentes dans un échantillon et le convertissons en une forme lisible par ordinateur.
Cela nous permet d'analyser précisément la composition bactérienne, qui est unique à chaque individu, tout comme une empreinte digitale. Même une petite quantité de selles contient assez d’ADN pour effectuer cette analyse détaillée
Interprétation des résultats. 📊
Analyser l'ADN et identifier les bactéries ne suffit pas ; il est essentiel de comprendre ce que ces résultats signifient.
Chez BIOMES, nous interprétons ces résultats grâce à notre base de connaissances, qui intègre les données de plus de 7 900 études cliniques et scientifiques sur le microbiome.
Nous ne retenons que les informations répondant à nos critères stricts et mettons à jour notre base de données presque quotidiennement. Ainsi, nous sommes toujours à la pointe de la recherche et fournissons des résultats basés sur des preuves scientifiques solides.
Des conseils personnalisés. 🍊
Les clients ne reçoivent pas seulement un rapport sur leur profil de microbiote; ils obtiennent également des recommandations personnalisées et scientifiquement fondées pour améliorer leur santé intestinale.
Cela leur permet de prendre des mesures concrètes pour optimiser leur bien-être général.
Le laboratoire BIOMES
Schwartzkopf Strasse 1,
15745, Wildau,
Allemagne